Il terzo altare di destra, realizzato nel 1681 da Giacinto Aicardi di Verezzi, è sormontato da un Crocifisso ligneo, eseguito nel 1693 per l’altare maggiore della chiesa barocca da Francesco Maria Agnesi, detto il Corsetto. La successiva cappella, con altare e cornici realizzati dal genovese Domenico Prato (1798), vede San Giovanni Nepomuceno tra San Francesco da Paola e Santa Lucia raffigurati in una tela del pittore bergamasco Giuseppe Paganelli vissuto tra fine Settecento e inizi Ottocento. Il braccio destro del transetto è occupato dal ricco altare della Madonna delle Grazie e delle Anime purganti, realizzato tra il 1718 e il 1728 da Pietro Ripa, secondo la tradizione reimpiegando colonne provenienti dalla distruzione di Castel Gavone nel 1715, rifasciate in marmo. Il dipinto è attribuito al finalese Pier Lorenzo Spoleti (1680-1726).